Divisão de Bioprocessos através das pesquisas relacionadas à fermentação da cana-de-açúcar e seus derivados, é missionada a fomentar dados de cunho cientifico e tecnológico para uns dos setores brasileiros de maior relevância, o sucroalcooleiro. Desenvolve suas pesquisas no sentido de gerar informações com base cientifica, disponibilizando para o setor da bioenergia brasileira para que possa ser aplicado diretamente no processo produtivo. A forma de financiamento das investigações desenvolvidas da DBP inclui, além dos órgãos de fomento, as próprias unidades produtoras, que utilizando os serviços da Divisão, na modalidade prestação de serviço, no sentido de entender os eventos que ocorrem em seus processos, acabam por serem também fomentadores de recursos para à pesquisa. As pesquisas estão focadas no entendimento da dinâmica da microbiota habitante das dornas de produção do bioetanol, de primeira e segunda geração. Encontrar processos para a produção do bioetanol, de custo reduzido e, portanto, acessível ao pequeno produtor é umas vocações do grupo que atua na Divisão. Dentro dessa atuação, a Divisão tem uma patente depositada a qual já foi licenciada. A Divisão atua ainda, na busca de biomoléculas de interesse comercial a partir do acesso de micro-organismos proveniente da cadeia produtiva da produção do açúcar e etanol, com ênfase nos produtos originários da atividade das leveduras do gênero Saccharomyces.